Si, lo del wagon lo había quitado y funcionaba. No estoy seguro si es redundante, usaba wagon-ftp para el deploy, porbaré a ver si es capaz de hacerlo sin ponerlo en el pom.xml.

Lo del encoding no ha habido manera, si en el código se cuela una ñ en nombre de variable o método, falla.

Muchas gracias y se bueno.

En cuanto al tema de los acentos y las Ñ´s, ¿la codificación de tus ficheros es UTF-8?, en caso afirmativo, basta con lanzar Maven con la opción -Dfile.encoding=UTF-8 (editando el fichero mvn en $MAVEN_HOME/bin).

El error de wagon no es de Sonar, es que la extensión de wagon está incluida en el core de Maven 2.0.9, ponerla de nuevo en el POM es redundante, prueba a quitarla.

Yo no he tenido ninguno de los problemas que comentas durante la instalación, supongo que será que he ido evolucionando al mismo ritmo que Sonar (comencé usando la versión 1.2.1) y no me he enfrentado a una instalación desde cero de las últimas versiones. Son errores realmente raros.

Un saludo.